SMARCA1 Література | Примітки | Див. також | Навігаційне...
Гени на хромосомі XНекатегоризовані білки
англ.амінокислотмолекулярна масаАланінЦистеїнАспарагінова кислотаГлутамінова кислотаФенілаланінГліцинГістидинІзолейцинЛізинЛейцинМетіонінАспарагінПролінГлутамінАргінінСеринТреонінВалінТриптофангідролазактиваторівгеліказрегуляторів хроматинуфосфопротеїнівтранскрипціятранскрипціїальтернативний сплайсингАТФнуклеотидамиядрі
| SMARCA1 | |||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | SMARCA1, ISWI, NURF140, SNF2L, SNF2L1, SNF2LB, SNF2LT, SWI, SWI2, hSNF2L, SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 1 | ||||||||||||||||
| Зовнішні ІД | MGI: 1935127 HomoloGene: 55711 GeneCards: SMARCA1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
| Шаблон експресії | |||||||||||||||||
   | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
| Ортологи | |||||||||||||||||
| Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
| Entrez |
|
| |||||||||||||||
| Ensembl |
|
| |||||||||||||||
| UniProt |
|
| |||||||||||||||
| RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
| RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
| Локус (UCSC) | Хр. X: 129.45 – 129.52 Mb | Хр. X: 47.81 – 47.89 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [1] | [2] | |||||||||||||||
| Вікідані | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
SMARCA1 (англ. SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 054 амінокислот, а молекулярна маса — 122 605[4].
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MEQDTAAVAA | TVAAADATAT | IVVIEDEQPG | PSTSQEEGAA | AAATEATAAT | ||||
| EKGEKKKEKN | VSSFQLKLAA | KAPKSEKEMD | PEYEEKMKAD | RAKRFEFLLK | ||||
| QTELFAHFIQ | PSAQKSPTSP | LNMKLGRPRI | KKDEKQSLIS | AGDYRHRRTE | ||||
| QEEDEELLSE | SRKTSNVCIR | FEVSPSYVKG | GPLRDYQIRG | LNWLISLYEN | ||||
| GVNGILADEM | GLGKTLQTIA | LLGYLKHYRN | IPGPHMVLVP | KSTLHNWMNE | ||||
| FKRWVPSLRV | ICFVGDKDAR | AAFIRDEMMP | GEWDVCVTSY | EMVIKEKSVF | ||||
| KKFHWRYLVI | DEAHRIKNEK | SKLSEIVREF | KSTNRLLLTG | TPLQNNLHEL | ||||
| WALLNFLLPD | VFNSADDFDS | WFDTKNCLGD | QKLVERLHAV | LKPFLLRRIK | ||||
| TDVEKSLPPK | KEIKIYLGLS | KMQREWYTKI | LMKDIDVLNS | SGKMDKMRLL | ||||
| NILMQLRKCC | NHPYLFDGAE | PGPPYTTDEH | IVSNSGKMVV | LDKLLAKLKE | ||||
| QGSRVLIFSQ | MTRLLDILED | YCMWRGYEYC | RLDGQTPHEE | REDKFLEVEF | ||||
| LGQREAIEAF | NAPNSSKFIF | MLSTRAGGLG | INLASADVVI | LYDSDWNPQV | ||||
| DLQAMDRAHR | IGQKKPVRVF | RLITDNTVEE | RIVERAEIKL | RLDSIVIQQG | ||||
| RLIDQQSNKL | AKEEMLQMIR | HGATHVFASK | ESELTDEDIT | TILERGEKKT | ||||
| AEMNERLQKM | GESSLRNFRM | DIEQSLYKFE | GEDYREKQKL | GMVEWIEPPK | ||||
| RERKANYAVD | AYFREALRVS | EPKIPKAPRP | PKQPNVQDFQ | FFPPRLFELL | ||||
| EKEILYYRKT | IGYKVPRNPD | IPNPALAQRE | EQKKIDGAEP | LTPEETEEKE | ||||
| KLLTQGFTNW | TKRDFNQFIK | ANEKYGRDDI | DNIAREVEGK | SPEEVMEYSA | ||||
| VFWERCNELQ | DIEKIMAQIE | RGEARIQRRI | SIKKALDAKI | ARYKAPFHQL | ||||
| RIQYGTSKGK | NYTEEEDRFL | ICMLHKMGFD | RENVYEELRQ | CVRNAPQFRF | ||||
| DWFIKSRTAM | EFQRRCNTLI | SLIEKENMEI | EERERAEKKK | RATKTPMVKF | ||||
| SAFS |
A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан
Y: Тирозин
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, активаторів, геліказ, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами.
Локалізований у ядрі.
Література |
.mw-parser-output .refbegin{font-size:90%;margin-bottom:0.5em}.mw-parser-output .refbegin-hanging-indents>ul{list-style-type:none;margin-left:0}.mw-parser-output .refbegin-hanging-indents>ul>li,.mw-parser-output .refbegin-hanging-indents>dl>dd{margin-left:0;padding-left:3.2em;text-indent:-3.2em;list-style:none}.mw-parser-output .refbegin-100{font-size:100%}
Barak O., Lazzaro M.A., Cooch N.S., Picketts D.J., Shiekhattar R. (2004). A tissue-specific, naturally occurring human SNF2L variant inactivates chromatin remodeling.. J. Biol. Chem. 279: 45130 — 45138. PubMed DOI:10.1074/jbc.M406212200
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки |
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11097 (англ.). Процитовано 13 вересня 2017.
↑ UniProt, P28370 (англ.). Процитовано 13 вересня 2017.
Див. також |
- Хромосома X
 | Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проекту, виправивши або дописавши її. |
 | На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка, скористайтеся підказкою та розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |
