Ryfujk

XRCC5;
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB ;
Список кодів PDB
	; 1JEQ, 1JEY, 1Q2Z, 1RW2, 3RZ9; ;
Ідентифікатори;
; Символи;	; XRCC5, KARP-1, KARP1, KU80, KUB2, Ku86, NFIV, Ku80, X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 5, X-ray repair cross complementing 5
Зовнішні ІД	; MGI: 104517 HomoloGene: 40681 GeneCards: XRCC5 ;
Онтологія гена
Молекулярна функція	; • DNA binding; • nucleotide binding; • double-stranded telomeric DNA binding; • telomeric DNA binding; • helicase activity; • 5'-deoxyribose-5-phosphate lyase activity; • ATP-dependent DNA helicase activity; • hydrolase activity, acting on acid anhydrides; • protein C-terminus binding; • protein binding; • transcription regulatory region DNA binding; • hydrolase activity; • ATP binding; • ubiquitin protein ligase binding; • double-stranded DNA binding; • damaged DNA binding; • RNA binding; • enzyme activator activity; • macromolecular complex binding; • DNA end binding; ; ;
Клітинна компонента	; • Цитоплазма; • Гіалоплазма; • nuclear telomere cap complex; • мембрана; • Цитоплазматична мембрана; • nucleoplasm; • Хромосома; • Ядерце; • nonhomologous end joining complex; • nuclear chromosome, telomeric region; • клітинне ядро; • extracellular region; • secretory granule lumen; • protein-DNA complex; • Білковий комплекс; • Ku70:Ku80 complex; • intracellular ribonucleoprotein complex; • macromolecular complex; • site of DNA damage; • Рибонуклеопротеїни; ; ;
Біологічний процес	; • DNA recombination; • regulation of transcription, DNA-templated; • regulation of smooth muscle cell proliferation; • transcription, DNA-templated; • cellular response to DNA damage stimulus; • positive regulation of neurogenesis; • hematopoietic stem cell differentiation; • double-strand break repair; • negative regulation of t-circle formation; • establishment of integrated proviral latency; • cell proliferation; • negative regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of type I interferon production; • response to drug; • cellular hyperosmotic salinity response; • Репарація ДНК; • DNA duplex unwinding; • brain development; • cellular response to fatty acid; • double-strand break repair via nonhomologous end joining; • neutrophil degranulation; • cellular response to gamma radiation; • cellular response to X-ray; • telomere maintenance; • regulation of telomere maintenance; • positive regulation of telomere maintenance via telomerase; • positive regulation of catalytic activity; • positive regulation of protein kinase activity; • positive regulation of telomerase activity; • protein localization to chromosome, telomeric region; • cellular response to leukemia inhibitory factor; • activation of innate immune response; • immune system process; • innate immune response; ; ;
	Джерела:Amigo / QuickGO;
Шаблон експресії;
	; ; ; ;
	; Більше даних;
Ортологи
	; 7520;
	; 22596;
	; ENSG00000079246;
	; ENSMUSG00000026187;
	; P13010;
	; P27641;
	; NM_021141;
	; NM_009533; NM_001357519; NM_001357520;
	; NP_066964;
	; NP_033559; NP_001344448; NP_001344449;
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Ku80 (англ. X-ray repair cross complementing 5) – білок, який кодується геном XRCC5, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 732 амінокислот, а молекулярна маса — 82 705^[4]. Разом з Ku70 формують Ku-гетеродимер

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVRSGNKAAV	VLCMDVGFTM	SNSIPGIESP	FEQAKKVITM	FVQRQVFAEN
KDEIALVLFG	TDGTDNPLSG	GDQYQNITVH	RHLMLPDFDL	LEDIESKIQP
GSQQADFLDA	LIVSMDVIQH	ETIGKKFEKR	HIEIFTDLSS	RFSKSQLDII
IHSLKKCDIS	LQFFLPFSLG	KEDGSGDRGD	GPFRLGGHGP	SFPLKGITEQ
QKEGLEIVKM	VMISLEGEDG	LDEIYSFSES	LRKLCVFKKI	ERHSIHWPCR
LTIGSNLSIR	IAAYKSILQE	RVKKTWTVVD	AKTLKKEDIQ	KETVYCLNDD
DETEVLKEDI	IQGFRYGSDI	VPFSKVDEEQ	MKYKSEGKCF	SVLGFCKSSQ
VQRRFFMGNQ	VLKVFAARDD	EAAAVALSSL	IHALDDLDMV	AIVRYAYDKR
ANPQVGVAFP	HIKHNYECLV	YVQLPFMEDL	RQYMFSSLKN	SKKYAPTEAQ
LNAVDALIDS	MSLAKKDEKT	DTLEDLFPTT	KIPNPRFQRL	FQCLLHRALH
PREPLPPIQQ	HIWNMLNPPA	EVTTKSQIPL	SKIKTLFPLI	EAKKKDQVTA
QEIFQDNHED	GPTAKKLKTE	QGGAHFSVSS	LAEGSVTSVG	SVNPAENFRV
LVKQKKASFE	EASNQLINHI	EQFLDTNETP	YFMKSIDCIR	AFREEAIKFS
EEQRFNNFLK	ALQEKVEIKQ	LNHFWEIVVQ	DGITLITKEE	ASGSSVTAEE
AKKFLAPKDK	PSGDTAAVFE	EGGDVDDLLD	MI

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, активаторів, геліказ.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, рекомбінація ДНК.
Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК.
Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література |

.mw-parser-output .refbegin{font-size:90%;margin-bottom:0.5em}.mw-parser-output .refbegin-hanging-indents>ul{list-style-type:none;margin-left:0}.mw-parser-output .refbegin-hanging-indents>ul>li,.mw-parser-output .refbegin-hanging-indents>dl>dd{margin-left:0;padding-left:3.2em;text-indent:-3.2em;list-style:none}.mw-parser-output .refbegin-100{font-size:100%}

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504

Oderwald H., Hughes M.J., Jost J.-P. (1996). Non-histone protein 1 (NHP1) is a member of the Ku protein family which is upregulated in differentiating mouse myoblasts and human promyelocytes.. FEBS Lett. 382: 313 — 318. PubMed DOI:10.1016/0014-5793(96)00189-5

Stuiver M.H., Coenjaerts F.E.J., van der Vlied P.C. (1990). The autoantigen Ku is indistinguishable from NF IV, a protein forming multimeric protein-DNA complexes.. J. Exp. Med. 172: 1049 — 1054. PubMed DOI:10.1084/jem.172.4.1049

Cao Q.P., Pitt S., Leszyk J., Baril E.F. (1994). DNA-dependent ATPase from HeLa cells is related to human Ku autoantigen.. Biochemistry 33: 8548 — 8557. PubMed DOI:10.1021/bi00194a021

Chan D.W., Ye R., Veillette C.J., Lees-Miller S.P. (1999). DNA-dependent protein kinase phosphorylation sites in Ku 70/80 heterodimer.. Biochemistry 38: 1819 — 1828. PubMed DOI:10.1021/bi982584b

Wang H., Fang R., Cho J.-Y., Libermann T.A., Oettgen P. (2004). Positive and negative modulation of the transcriptional activity of the ETS factor ESE-1 through interaction with p300, CREB-binding protein, and Ku 70/86.. J. Biol. Chem. 279: 25241 — 25250. PubMed DOI:10.1074/jbc.M401356200

Примітки |

↑ Human PubMed Reference:.

↑ Mouse PubMed Reference:.

↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12833 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.

↑ UniProt, P13010 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також |

Хромосома 2

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проекту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12833 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.

[UniProt-4] UniProt, P13010 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.

搜尋此網誌

Ryfujk

Ku80 Література | Примітки | Див. також | Навігаційне...

Література |

Примітки |

Див. також |

Popular posts from this blog

Фонтен-ла-Гаярд Зміст Демографія | Економіка | Посилання |...

Список ссавців Італії Природоохоронні статуси | Список |...

Маріан Котлеба Зміст Життєпис | Політичні погляди |...