Ryfujk

SIRT2;
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB ;
Список кодів PDB
	; 1J8F, 3ZGO, 3ZGV, 4L3O, 4R8M, 4RMG, 4RMH, 4RMI, 4RMJ, 4Y6O, 5DY4, 5D7O, 5DY5, 4Y6L, 4Y6Q, 4X3O, 4X3P, 5D7P, 5D7Q, 5FYQ; ;
Ідентифікатори;
; Символи;	; SIRT2, SIR2, SIR2L, SIR2L2, sirtuin 2
Зовнішні ІД	; MGI: 1927664 HomoloGene: 40823 GeneCards: SIRT2 ;
Онтологія гена
Молекулярна функція	; • histone deacetylase binding; • transcription factor binding; • зв'язування з іоном металу; • protein deacetylase activity; • zinc ion binding; • chromatin binding; • protein binding; • histone acetyltransferase binding; • tubulin deacetylase activity; • NAD-dependent histone deacetylase activity (H4-K16 specific); • NAD-dependent protein deacetylase activity; • histone deacetylase activity; • ubiquitin binding; • NAD+ binding; • beta-tubulin binding; • NAD+ ADP-ribosyltransferase activity; • hydrolase activity; • NAD-dependent histone deacetylase activity; ; ;
Клітинна компонента	; • Цитоплазма; • Гіалоплазма; • мембрана; • Центр організації мікротрубочок; • chromatin silencing complex; • perinuclear region of cytoplasm; • paranode region of axon; • Мікротрубочки; • Цитоскелет; • клітинне ядро; • Центросома; • cell projection; • Мієлін; • glial cell projection; • Schmidt-Lanterman incisure; • paranodal junction; • Перикаріон; • growth cone; • Веретено поділу; • Хромосома; • lateral loop; • mitotic spindle; • meiotic spindle; • nuclear heterochromatin; • midbody; • Центріоль; • juxtaparanode region of axon; • chromosome, telomeric region; • Ядерце; • Мітохондрія; • Цитоплазматична мембрана; ; ;
Біологічний процес	; • cellular response to molecule of bacterial origin; • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process involved in cellular response to hypoxia; • cellular response to epinephrine stimulus; • tubulin deacetylation; • chromatin silencing at rDNA; • phosphatidylinositol 3-kinase signaling; • Клітинний цикл; • positive regulation of DNA binding; • negative regulation of autophagy; • cellular response to hypoxia; • negative regulation of cell proliferation; • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process; • cellular lipid catabolic process; • histone H3 deacetylation; • peptidyl-lysine deacetylation; • negative regulation of fat cell differentiation; • regulation of transcription, DNA-templated; • substantia nigra development; • negative regulation of protein catabolic process; • negative regulation of NLRP3 inflammasome complex assembly; • negative regulation of oligodendrocyte progenitor proliferation; • regulation of fat cell differentiation; • transcription, DNA-templated; • myelination in peripheral nervous system; • histone H4 deacetylation; • chromatin silencing at telomere; • regulation of myelination; • innate immune response; • hepatocyte growth factor receptor signaling pathway; • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process; • regulation of exit from mitosis; • Диференціація клітин; • chromatin silencing; • protein ADP-ribosylation; • immune system process; • cellular response to hepatocyte growth factor stimulus; • negative regulation of peptidyl-threonine phosphorylation; • regulation of phosphorylation; • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter; • nervous system development; • response to redox state; • protein deacetylation; • positive regulation of attachment of spindle microtubules to kinetochore; • meiotic cell cycle; • cellular response to caloric restriction; • ripoptosome assembly involved in necroptotic process; • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia; • negative regulation of transcription, DNA-templated; • gene silencing; • negative regulation of defense response to bacterium; • positive regulation of execution phase of apoptosis; • protein kinase B signaling; • negative regulation of striated muscle tissue development; • positive regulation of oocyte maturation; • regulation of cell cycle; • Поділ клітини; • Автофагія; • positive regulation of meiotic nuclear division; • cellular response to oxidative stress; • negative regulation of reactive oxygen species metabolic process; • histone deacetylation; • positive regulation of cell division; • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter; ; ;
	Джерела:Amigo / QuickGO;
Шаблон експресії;
	; Більше даних;
Ортологи
	; 22933;
	; 64383;
	; ENSG00000283100; ENSG00000068903;
	; ENSMUSG00000015149;
	; Q8IXJ6;
	; Q8VDQ8;
	; NM_001193286; NM_012237; NM_030593;
	; NM_001122765; NM_001122766; NM_022432;
	; NP_001180215; NP_036369; NP_085096;
	; NP_001116237; NP_001116238; NP_071877;
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SIRT2 (англ. Sirtuin 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 389 амінокислот, а молекулярна маса — 43 182^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAEPDPSHPL	ETQAGKVQEA	QDSDSDSEGG	AAGGEADMDF	LRNLFSQTLS
LGSQKERLLD	ELTLEGVARY	MQSERCRRVI	CLVGAGISTS	AGIPDFRSPS
TGLYDNLEKY	HLPYPEAIFE	ISYFKKHPEP	FFALAKELYP	GQFKPTICHY
FMRLLKDKGL	LLRCYTQNID	TLERIAGLEQ	EDLVEAHGTF	YTSHCVSASC
RHEYPLSWMK	EKIFSEVTPK	CEDCQSLVKP	DIVFFGESLP	ARFFSCMQSD
FLKVDLLLVM	GTSLQVQPFA	SLISKAPLST	PRLLINKEKA	GQSDPFLGMI
MGLGGGMDFD	SKKAYRDVAW	LGECDQGCLA	LAELLGWKKE	LEDLVRREHA
SIDAQSGAGV	PNPSTSASPK	KSPPPAKDEA	RTTEREKPQ

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, автофагія, диференціація клітин, нейрогенез, мейоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з НАД, іонами металів, іоном цинку.
Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, клітинних відростках, хромосомах.

Література |

.mw-parser-output .refbegin{font-size:90%;margin-bottom:0.5em}.mw-parser-output .refbegin-hanging-indents>ul{list-style-type:none;margin-left:0}.mw-parser-output .refbegin-hanging-indents>ul>li,.mw-parser-output .refbegin-hanging-indents>dl>dd{margin-left:0;padding-left:3.2em;text-indent:-3.2em;list-style:none}.mw-parser-output .refbegin-100{font-size:100%}

Frye R.A. (1999). Characterization of five human cDNAs with homology to the yeast SIR2 gene: Sir2-like proteins (sirtuins) metabolize NAD and may have protein ADP-ribosyltransferase activity.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 260: 273 — 279. PubMed DOI:10.1006/bbrc.1999.0897

Afshar G., Murnane J.P. (1999). Characterization of a human gene with sequence homology to Saccharomyces cerevisiae SIR2.. Gene 234: 161 — 168. PubMed DOI:10.1016/S0378-1119(99)00162-6

Rack J.G., Vanlinden M.R., Lutter T., Aasland R., Ziegler M. (2014). Constitutive nuclear localization of an alternatively spliced sirtuin-2 isoform.. J. Mol. Biol. 426: 1677 — 1691. PubMed DOI:10.1016/j.jmb.2013.10.027

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504

Grozinger C.M., Chao E.D., Blackwell H.E., Moazed D., Schreiber S.L. (2001). Identification of a class of small molecule inhibitors of the sirtuin family of NAD-dependent deacetylases by phenotypic screening.. J. Biol. Chem. 276: 38837 — 38843. PubMed DOI:10.1074/jbc.M106779200

North B.J., Marshall B.L., Borra M.T., Denu J.M., Verdin E. (2003). The human Sir2 ortholog, SIRT2, is an NAD+-dependent tubulin deacetylase.. Mol. Cell 11: 437 — 444. PubMed DOI:10.1016/S1097-2765(03)00038-8

Примітки |

↑ Human PubMed Reference:.

↑ Mouse PubMed Reference:.

↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10886 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

↑ UniProt, Q8IXJ6 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також |

Хромосома 19

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проекту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10886 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q8IXJ6 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

搜尋此網誌

Ryfujk

SIRT2 Література | Примітки | Див. також | Навігаційне...

Література |

Примітки |

Див. також |

Popular posts from this blog

As a Security Precaution, the user account has been locked The Next CEO of Stack OverflowMS...

Список ссавців Італії Природоохоронні статуси | Список |...

Українські прізвища Зміст Історичні відомості |...