SYT7 Література | Примітки | Див. також | Навігаційне...


Гени на хромосомі 11Некатегоризовані білки


англ.амінокислотмолекулярна масафосфопротеїнівекзоцитозальтернативний сплайсингкальмодулінукальціюклітинній мембраніцитоплазматичнихвезикулахлізосоміпероксисомахсинапсах

































































SYT7
Protein SYT7 PDB 2d8k.png










Наявні структури
PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB






Ідентифікатори

Символи

SYT7, IPCA-7, IPCA7, PCANAP7, SYT-VII, SYTVII, synaptotagmin 7
Зовнішні ІД
MGI: 1859545 HomoloGene: 20889 GeneCards: SYT7



















Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl









UniProt









RefSeq (мРНК)





NM_001252065
NM_001300773
NM_004200
NM_001365809







NM_018801
NM_173067
NM_173068

RefSeq (білок)





NP_001238994
NP_001287702
NP_004191
NP_001352738





NP_061271
NP_775090
NP_775091

Локус (UCSC)
Хр. 11: 61.52 – 61.58 Mb

Хр. 19: 10.39 – 10.45 Mb

PubMed search

[1]
[2]
Вікідані



Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SYT7 (англ. Synaptotagmin 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 403 амінокислот, а молекулярна маса — 45 501[4].



Послідовність амінокислот







































































































10 20 30 40 50

MYRDPEAASP

GAPSRDVLLV

SAIITVSLSV

TVVLCGLCHW

CQRKLGKRYK

NSLETVGTPD

SGRGRSEKKA

IKLPAGGKAV

NTAPVPGQTP

HDESDRRTEP

RSSVSDLVNS

LTSEMLMLSP

GSEEDEAHEG

CSRENLGRIQ

FSVGYNFQES

TLTVKIMKAQ

ELPAKDFSGT

SDPFVKIYLL

PDKKHKLETK

VKRKNLNPHW

NETFLFEGFP

YEKVVQRILY

LQVLDYDRFS

RNDPIGEVSI

PLNKVDLTQM

QTFWKDLKPC

SDGSGSRGEL

LLSLCYNPSA

NSIIVNIIKA

RNLKAMDIGG

TSDPYVKVWL

MYKDKRVEKK

KTVTMKRNLN

PIFNESFAFD

IPTEKLRETT

IIITVMDKDK

LSRNDVIGKI

YLSWKSGPGE

VKHWKDMIAR

PRQPVAQWHQ

LKA



Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як екзоцитоз, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з молекулою кальмодуліну, іонами металів, іоном кальцію.
Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, лізосомі, пероксисомах, синапсах.



Література |


.mw-parser-output .refbegin{font-size:90%;margin-bottom:0.5em}.mw-parser-output .refbegin-hanging-indents>ul{list-style-type:none;margin-left:0}.mw-parser-output .refbegin-hanging-indents>ul>li,.mw-parser-output .refbegin-hanging-indents>dl>dd{margin-left:0;padding-left:3.2em;text-indent:-3.2em;list-style:none}.mw-parser-output .refbegin-100{font-size:100%}



  • Cooper P.R., Nowak N.J., Higgins M.J., Church D.M., Shows T.B. (1998). Transcript mapping of the human chromosome 11q12-q13.1 gene-rich region identifies several newly described conserved genes.. Genomics 49: 419 — 429.  PubMed DOI:10.1006/geno.1998.5291


  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004.  PubMed DOI:10.1101/gr.2596504


  • Caler E.V., Chakrabarti S., Fowler K.T., Rao S., Andrews N.W. (2001). The Exocytosis-regulatory protein synaptotagmin VII mediates cell invasion by Trypanosoma cruzi.. J. Exp. Med. 193: 1097 — 1104.  PubMed DOI:10.1084/jem.193.9.1097


  • Fukuda M., Ogata Y., Saegusa C., Kanno E., Mikoshiba K. (2002). Alternative splicing isoforms of synaptotagmin VII in the mouse, rat and human.. Biochem. J. 365: 173 — 180.  PubMed DOI:10.1042/BJ20011877


  • Chakrabarti S., Andrade L.O., Andrews N.W. (2005). Trypanosoma cruzi invades synaptotagmin VII-deficient cells by a PI-3 kinase independent pathway.. Mol. Biochem. Parasitol. 141: 125 — 128.  PubMed DOI:10.1016/j.molbiopara.2005.01.016


  • Brandt D.S., Coffman M.D., Falke J.J., Knight J.D. (2012). Hydrophobic contributions to the membrane docking of synaptotagmin 7 C2A domain: mechanistic contrast between isoforms 1 and 7.. Biochemistry 51: 7654 — 7664.  PubMed DOI:10.1021/bi3007115




Примітки |





  1. Human PubMed Reference:. 


  2. Mouse PubMed Reference:. 


  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11514 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017. 


  4. UniProt, O43581 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017. 




Див. також |


  • Хромосома 11







Popular posts from this blog

117736 Шеррод Примітки | Див. також | Посилання | Навігаційне...

As a Security Precaution, the user account has been locked The Next CEO of Stack OverflowMS...

Маріан Котлеба Зміст Життєпис | Політичні погляди |...